В «бросовой» ДНК обнаружился неизвестный вирус
Случайное открытие предоставило новый метод для обнаружения неизвестных вирусов.
В проекте, представленном в Virus Evolution, сотрудники зоологической кафедры Оксфордского университета показали, что секвенирование нового поколения и связанные с ней онлайн-базы данных ДНК могут использоваться в сфере обнаружения вирусов. Ученые разработали алгоритм, выявляющий гены инфекционных агентов в крови или образцах ткани рыб, сообщает Phys.org. Метод может применяться и для других видов.
Доктора Арис Кацууракис и Амр Асвад случайно выявили новые функции генетических баз данных. В поисках древнего вируса герпеса приматов, они обнаружили признаки двух ранее неизвестных агентов. Проверяя, удастся ли добиться аналогичного результата, специалисты проанализировали более 50 рыбьих геномов на наличие распознаваемой вирусной ДНК. Вместе с ожидаемым герпесом, они нашли необычные структуры, которые могут принадлежать к новому семейству. Черты вирусов присутствовали в образцах 15 различных видов рыб, включая атлантического лосося и радужную форель.
«В первом случае мы нашли нечто, похожее на полный и независимый вирусный геном вместе с дюжинами фрагментов ДНК, — объяснил Кацууракис. – Недавние исследования показывают, что вирусы могут внедряться в геномы хозяев, иногда сохраняясь в них миллионы лет. Здесь, вероятно, они получили эту возможность за счет кражи генов лосося, что объясняет распространенность структур».
Успех проекта заключается в объединении эволюционной биологии и геномики. Науки легли в основу палеовирологии, изучающей древние вирусы, внедрившиеся в ДНК хозяев. Ранее ученые часто относили такие данные к категории «бросовых», отфильтровывая их в процессе анализа.
«Исследование показало, что мы могли выбрасывать важные сведения», — отметил доктор Асвад.
В будущем авторы планируют проверить, как древние вирусы влияют на течение болезней и другие аспекты здоровья рыб.
Исследование представлено в Virus Evolution.
Материалы партнеров:
Читайте другие новости:
Читайте также